​與普通鼠標相比，工業觸控鼠標在實際使用手感方麵，還有一定程度的欠缺。觸控式鼠標上蓋部分為一整體設計(為方便用戶進行觸控操作)，整個按鍵板下方僅有一枚微動開關，左右按鍵的點擊操作均通過這一微動完成，鼠標通過識別用戶在按鍵板上的點擊位置，來識別左/右按鍵點擊。
由於工業觸控鼠標按鍵板為一整體設計，且下方僅有一枚微動，所以用戶在使用時，很可能由於點擊位置偏差，造成誤按現象的發生。單微動設計，為用戶使用所帶來的影響，還不僅止於此，由於需要通過對用戶手指點擊位置進行識別，來判斷左/右鍵操作，觸控鼠標無法在用戶食指不離開鼠標按鍵板時，完成右鍵點擊操作。對於許多用戶來說，使用觸控鼠標，也許意味著操作習慣的巨大改變。

還是因為觸控鼠標的整體式按鍵設計，由於杠杆原理，觸控鼠標按鍵下壓行程偏長，點擊手感普遍偏肉。用戶很難在觸控鼠標上，找到同普通鼠標一樣的清脆、明朗的點擊手感。廠商如果不在鼠標內部結構上作出調整，很難讓觸控鼠標擁有與普通鼠標相近似的點擊手感。

而觸控鼠標作為一種新鮮事物，在操作方式上，肯定需要習慣一段時間，究竟喜不喜歡，就看自己了，並且現在市場上的觸控鼠標分為兩種，一種是全觸控操作方式，目前未發現，在一種則是為了用戶能夠更好的上手，僅有鼠標滾輪支持觸控，代表性的有微軟最新的靈動觸控鼠標和梅賽伯X1觸控鼠標。

前一種勝於外觀時尚炫麗、操作方式新穎、有範兒，後一種則照顧傳統的操作方式，上手簡單，而獨特的觸控滾輪，也能滿足用戶的好奇心。